Achso, ich bin jetzt davon ausgegangen, dass dein Gartenhaus von unten her gegen Nässe und Kälte geschützt ist.
Da würd ich aber generell mal versuchen, dem Problem entgegenzuwirken. Es sollte auch in der Gartenhütte kein Wasser reinkommen und keine Kälte von unten aufsteigen. Man darf nicht vergessen, dass sich die Meerschweinchen ja sehr bodennah aufhalten.
Wird da nicht deine Einstreu nass?
Zeig doch mal ein Foto, dann kann man sich das vielleicht besser vorstellen.
Ich würd da eher vor dem Winter auf die Steinplatten vielleicht eine dicke Schickt Styropor rauflegen, dann Teichfolie drauf, dann könnte auch kein Wasser von unten her eindringen, es liesse sich leicht reinigen.
(Oder regnet es bei Starkregen von oben her rein?
Mit Bodenplatte schützen meinte ich den Boden deines Igelhauses. Der wird vom Urin nass werden. Einfacher Spielzeuglack wird da nicht reichen. Das Holz würde quasi schnell "versiffen".