Um ganz sicher zu gehen, dass es wirklich nur Schuppen sind, pack deine 3 Süssen ein und geh mit ihnen zum Tierarzt. So "harmlos" sich das ganze anhört, aber so manche Parasiten können einem Meerschweinchen so zusetzen, dass es daran stirbt.
Wenn du dir aber 190%ig sicher bist, dass es wirklich nur Schuppen sind, würde ich das Bürsten mal mindestens zwei Wochen sein lassen. Möglicherweise ist die Haut, die bei Meerschweinchen eh schon sehr empfindlich ist, ausgetrocknet und gereizt. Glatthaarmeerschweinchen brauchen eh nicht gebürstet werden, bei Rosettenmeerschweinchen ist es sogar mehr als unangenehm, wegen den Haarwirbeln.
Als Hilfe von Außen kannst du ihnen ein bis zwei Sonnenblumkerne mehr anbieten. Das Öl in den Kernen hilft den Meerlis, dass sie sie Haut und Fell regenerieren können... Auch eine extra Vitaminbombe (Fenchel/Paprika/Hagebutten) kann hilfreich sein.