Hallo
Also man sollte sich (wenn man nicht sehr sehr viel Erfahrung auf dem Gebiet hat) immer zuerst von einem Tierarzt beraten lassen, bevor man da mit irgendwas rumdoktert.
Bedenke, dass Meerschweinchen Medikamente auch ablecken oder in dem Fall mit einer Pfote ins Maul bugsieren können - da sollte man nicht einfach irgendwas drauf schmieren.
Zudem: Pilz ist hoch ansteckend, sowohl für andere Meeris als auch für euch. Ihr wärt in jedem Fall mit einem TA-Besuch besser gefahren - dann wär der Pilz sicher schon weg (es klingt so, als hätte es den Pilz schon länger) und die Ansteckungsgefahr nicht mehr da.