In welchen Situationen tritt das Niesen denn auf? Es kann schon sein, dass die Einstreu vielleicht dazu führt. Oder ein Heuhalm der in der Nase kitzelt. Manchmal verschlucken sie sich auch einfach beim Fressen und müssen dann sowas ähnliches wie "husten" was sich oft anhört wie ein Niesen.
Also erstmal kein Grund zur Sorge.