Riecht es denn nach Urin oder nach Böhnchen?
Richtig auffällig nach Urin gerochen hatte es bei uns vor allem einmal, als Wuschel eine Blasenentzündung hatte. Die Böhnchen riechen manchmal mehr, als Reaktion auf ein nicht ganz optimales Futter. Das kann z.B. eine bestimmte Grassorte sein.
Wenn die Haltung ohne Streu zumindest einem Tier deutlich besser bekommt, würde ich es noch weiter versuchen. Zumindest versuchsweise würde ich alle feuchten Matten mindestens einmal täglich herausnehmen. Böhnchen müssen m.E. ohnehin ein- bis zweimal täglich entfernt werden bei Haltung auf Stoffen.